Д-р Клара Балджиева е председател на Национално сдружение на педиатрите-специалисти от извънболничната помощ. Член е в работна група към Министерство на здравеопазването за създаване на „Национална програма първична профилактика на рака на маточната шийка в България 2012-2016 г.” Член на Координационният съвет на „Национална програма за анализ и контрол на ротавирусните гастроентерити.” Член на Управителният съвет на Столична лекарска колегия в два последователни мандата 2005/2011г.